El inmueble que hoy conocemos fue reedificado a principios del siglo XVIII con la ayuda de algunos de los benefactores de la Compañía de Jesús, como lo fueron el marqués de Villapuente de la Peña y la marquesa de las Torres de Rada, y es considerado uno de los ejemplos más sobresalientes de la arquitectura civil de la ciudad de México.
En la actualidad, el Antiguo Colegio de San Ildefonso es un museo que se encuentra localizado en el Centro Histórico de la Ciudad, en la calle de Justo Sierra 16. Alberga un importante acervo arqueológico, histórico y artístico.
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